15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1137 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1137  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  564  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15748  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  40.48 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  30.51 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  33.05 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  30.83 
 
 
306 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.16 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.33 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  32.81 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2560  hypothetical protein  36.84 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  28 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  36.62 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  41.94 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16420  hypothetical protein  39.24 
 
 
428 aa  43.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.20309  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  31.25 
 
 
361 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  34.38 
 
 
318 aa  42.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>