7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2560 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2560  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  707    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2321  HPr kinase  32.35 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3877  hypothetical protein  24.2 
 
 		 382 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2830  hypothetical protein  30.99 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3875  hypothetical protein  29.2 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1137  hypothetical protein  36.84 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2895  HPr kinase  32.61 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>