13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2895 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2895  HPr kinase  100 
 
 		 298 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24640  hypothetical protein  38.78 
 
 		 250 aa  52.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  38.3 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  28.07 
 
 		 148 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  33.33 
 
 		 142 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1769  HPr kinase  27.65 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2321  HPr kinase  29 
 
 		 364 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2343  hypothetical protein  30.43 
 
 		 203 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259056  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1683  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.94 
 
 		 142 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  31.94 
 
 		 142 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2560  hypothetical protein  32.61 
 
 		 348 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  28.05 
 
 		 398 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  24.73 
 
 		 347 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>