13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2321 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2321  HPr kinase  100 
 
 
364 aa  753    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0158  HPr kinase  35.13 
 
 
371 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0181817 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1769  HPr kinase  37.33 
 
 
373 aa  222  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2699  HPr kinase  35.88 
 
 
356 aa  212  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1985  HPr kinase  34.9 
 
 
375 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2560  hypothetical protein  32.35 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2830  hypothetical protein  34.52 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4010  hypothetical protein  35.37 
 
 
337 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  32.17 
 
 
325 aa  50.4  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24640  hypothetical protein  39.39 
 
 
250 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3877  hypothetical protein  22.38 
 
 
382 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  26.8 
 
 
311 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2895  HPr kinase  29 
 
 
298 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>