14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_24640 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_24640  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2895  HPr kinase  38.78 
 
 
298 aa  52  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2830  hypothetical protein  29.79 
 
 
372 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  44.26 
 
 
325 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3877  hypothetical protein  29.03 
 
 
382 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2321  HPr kinase  39.39 
 
 
364 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2827  hypothetical protein  36.51 
 
 
341 aa  45.4  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  38.46 
 
 
317 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4010  hypothetical protein  30.56 
 
 
337 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  27.68 
 
 
322 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4502  HPr kinase  42.86 
 
 
313 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  43.75 
 
 
142 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  25.64 
 
 
329 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2560  hypothetical protein  24.22 
 
 
348 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>