41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0966 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  621  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  32.53 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  29.54 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.45 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.55 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  30 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  28.57 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  30.88 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  28.95 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  34.09 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  29.29 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  29.9 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  48.7 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  29.47 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.62 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  31.77 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.17 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  32.89 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.22 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  29.3 
 
 		 268 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  35.96 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2827  hypothetical protein  32.5 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  33.85 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  28.95 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  26.14 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.07 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  37.97 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2373  HPr kinase  29.19 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4502  HPr kinase  41.1 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29.76 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0851  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  38.81 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  40 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1592  HPr kinase  30.59 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24640  hypothetical protein  38.46 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  33.33 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16420  hypothetical protein  38.36 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.20309  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1137  hypothetical protein  36.62 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  29.58 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1353  hypothetical protein  27.57 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  31.43 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>