24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2445 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  100 
 
 
313 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  46.95 
 
 
285 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.78 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  40.27 
 
 
307 aa  218  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  38.46 
 
 
301 aa  209  5e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  37.76 
 
 
303 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  34.11 
 
 
305 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  33.93 
 
 
303 aa  185  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  36.78 
 
 
304 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35.89 
 
 
293 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  35.08 
 
 
330 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  33.5 
 
 
203 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.62 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  40.45 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  24.44 
 
 
404 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1918  hypothetical protein  26.92 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.67 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  36.21 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  27.6 
 
 
366 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40.35 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  24.86 
 
 
398 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16420  hypothetical protein  25.82 
 
 
428 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.20309  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  37.04 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>