20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0594 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  100 
 
 
307 aa  619  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  40.92 
 
 
309 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  40.27 
 
 
313 aa  218  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  41.61 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  39.74 
 
 
303 aa  212  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  36.33 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  38.31 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  34.21 
 
 
303 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  42.45 
 
 
285 aa  193  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  37.72 
 
 
293 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  37.98 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  35.19 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  32 
 
 
203 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  27.84 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  29.73 
 
 
366 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  40.51 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  25.27 
 
 
398 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  53.19 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  43.48 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  52.17 
 
 
323 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>