37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1373 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  100 
 
 		 330 aa  648    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  55.16 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  37.68 
 
 		 285 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  35.08 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  32.97 
 
 		 303 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  35.19 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  41.71 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  34.7 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.52 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.52 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  30.43 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  28.73 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  28.99 
 
 		 203 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  32.6 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.34 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  56.36 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  44.12 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  28.95 
 
 		 268 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  40.85 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  28.81 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  32.54 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  47.54 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  34.88 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29.59 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  28.57 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  45.61 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2373  HPr kinase  26.15 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  36.14 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  44.07 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  31.4 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1918  hypothetical protein  26.37 
 
 		 270 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  24.48 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3012  HPr kinase  28.41 
 
 		 398 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  38.81 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1910  hypothetical protein  41.67 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  30 
 
 		 325 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>