46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1585 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  100 
 
 
326 aa  649    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  32.31 
 
 
347 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  23.38 
 
 
322 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  27.52 
 
 
288 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  33.33 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  35.71 
 
 
316 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  35.62 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  33.71 
 
 
268 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  23.63 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  40 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  39.44 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  30.2 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  38.98 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2830  hypothetical protein  26.06 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  28.81 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  27.42 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2092  hypothetical protein  39.34 
 
 
159 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.82 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  37.93 
 
 
306 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  37.93 
 
 
306 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  32.26 
 
 
173 aa  47  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  28.74 
 
 
309 aa  46.2  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  36.92 
 
 
330 aa  45.8  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  26.02 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  38.33 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  35.14 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  36.92 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0584  HPr kinase/phosphorylase  41.82 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.912701  normal  0.136468 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1985  HPr kinase  28.38 
 
 
375 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1592  HPr kinase  33.85 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0851  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  43.1 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2012  hypothetical protein  37.7 
 
 
159 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0388749  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  36 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  37.84 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  35.14 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  35.29 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1769  HPr kinase  37.88 
 
 
373 aa  43.9  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  47.73 
 
 
154 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  38.46 
 
 
308 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35 
 
 
330 aa  43.1  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  31.03 
 
 
324 aa  42.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0826  HPr kinase  37.7 
 
 
160 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  35.62 
 
 
311 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  30.85 
 
 
308 aa  42.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1622  HPr kinase/phosphorylase  42.86 
 
 
332 aa  42.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2851  HPr kinase  34.78 
 
 
142 aa  42.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.869678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>