8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1769 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1769  HPr kinase  100 
 
 		 373 aa  771    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0158  HPr kinase  37.64 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181817 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2321  HPr kinase  34.46 
 
 		 364 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2699  HPr kinase  34.51 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1985  HPr kinase  34.75 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2830  hypothetical protein  25.57 
 
 		 372 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2895  HPr kinase  27.65 
 
 		 298 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  39.22 
 
 		 326 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>