113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2558 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 
306 aa  593  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  98.69 
 
 
306 aa  584  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  88.41 
 
 
307 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.16 
 
 
323 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  28.29 
 
 
325 aa  92.4  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  29.08 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  33.99 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35.36 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  30.4 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  30.9 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  27.67 
 
 
316 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  37.18 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  27.8 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  27.76 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  25.54 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  28.94 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.61 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  34.52 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2827  hypothetical protein  34.39 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  25.87 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.15 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  31.76 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1592  HPr kinase  41.94 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  25.91 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0364  HPr kinase  46.81 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.006101  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0369  HPr kinase  41.18 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1059  HPr kinase/phosphorylase  48.94 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.288916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0110  HPr kinase  43.18 
 
 
318 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0428  HPr kinase/phosphorylase  45.83 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0719  HPr kinase/phosphorylase  44.23 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  43.1 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0328  HPr kinase  42.55 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0519  HPr kinase/phosphorylase  35.48 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  39.33 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1328  HPr kinase/phosphorylase  47.83 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959329  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1137  hypothetical protein  32.09 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15748  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0238  HPr kinase  46.43 
 
 
320 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3381  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  45.28 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2552  HPr kinase  44.68 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  27.53 
 
 
300 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0784  HPr kinase/phosphorylase  45.65 
 
 
310 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.35663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0801  HPr kinase/phosphorylase  45.65 
 
 
310 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  36.96 
 
 
308 aa  47  0.0004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2987  HPr kinase/phosphorylase  45.1 
 
 
311 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.223835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4209  HPr kinase  45.65 
 
 
339 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250553  normal  0.955997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  41.51 
 
 
331 aa  46.2  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0405  HPr kinase/phosphorylase  39.68 
 
 
324 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0260  HPr kinase/phosphorylase  39.68 
 
 
324 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2293  HPr kinase  31.43 
 
 
308 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0287  HPr kinase/phosphorylase  39.68 
 
 
324 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.811002  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1622  HPr kinase/phosphorylase  41.51 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3706  HPr kinase/phosphorylase  44.44 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3171  HPr kinase/phosphorylase  44.44 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0124  HPr kinase  42.22 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  47.73 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1043  HPr kinase  43.48 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5267  HPr kinase/phosphorylase  42.22 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0736  HPr kinase/phosphorylase  41.3 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5012  HPr kinase/phosphorylase  42.22 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4841  HPr kinase/phosphorylase  42.22 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4856  HPr kinase/phosphorylase  42.22 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  41.51 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5392  HPr kinase/phosphorylase  42.22 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0538  HPr kinase  47.83 
 
 
154 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  30.77 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2129  HPr kinase  50.94 
 
 
173 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.163054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2758  HPr kinase  33.7 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.391221  normal  0.0327459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4956  HPr kinase/phosphorylase  42.22 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1758  HPr kinase  47.83 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5324  HPr kinase/phosphorylase  42.22 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5282  HPr kinase/phosphorylase  42.22 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.101146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5675  HPr kinase/phosphorylase  42.22 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16040  HPr kinase  42.55 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0352  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6124  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120463  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0299  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2049  HPr kinase  34.65 
 
 
148 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.824494  normal  0.123251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1155  HPr kinase  36.51 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129901  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5248  HPr kinase/phosphorylase  42.22 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3111  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  43.48 
 
 
311 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0762  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0483  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4125  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2180  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1261  HPr kinase/phosphorylase  42.55 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000389746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1074  HPr kinase/phosphorylase  42.55 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0637079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2854  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2794  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0079  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1511  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0578  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0594  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2939  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0521  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0323  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0593  HPr kinase/phosphorylase  38.1 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.00537936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0584  HPr kinase/phosphorylase  44.44 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.912701  normal  0.136468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0530  HPr kinase/phosphorylase  39.68 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.620799  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0146  HPr kinase/phosphorylase  43.48 
 
 
321 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>