21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3381 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3381  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 
333 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3352  HPr kinase  28.57 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  26.67 
 
 
316 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0082  HPr kinase/phosphorylase  44.44 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  45.28 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  42.31 
 
 
301 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  43.4 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0613  HPr kinase/phosphorylase  43.18 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.796182  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0690  HPr kinase/phosphorylase  43.18 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1622  HPr kinase/phosphorylase  43.18 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  36.36 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  29.67 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  42.37 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1764  HPr kinase/phosphorylase  43.18 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  26.37 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  41.94 
 
 
288 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2552  HPr kinase  40.43 
 
 
339 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0566  HPr kinase/phosphorylase  43.18 
 
 
322 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.46 
 
 
323 aa  42.7  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  35.42 
 
 
347 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4146  HPr kinase/phosphorylase  32.05 
 
 
311 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.53594  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>