30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2007 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  100 
 
 		 301 aa  611  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  39.19 
 
 		 313 aa  223  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  31.51 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  27.93 
 
 		 324 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.2 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  27.3 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  29.9 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  29.47 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  35.92 
 
 		 330 aa  86.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.33 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.18 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  26.94 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  36.3 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  38.52 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  32.1 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  28.27 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  26.53 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2558  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.51 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  37.5 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  30.06 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  25.99 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0851  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.73 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  30.59 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  23.42 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2827  hypothetical protein  28.02 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1353  hypothetical protein  28.03 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  29.27 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4502  HPr kinase  35.37 
 
 		 313 aa  45.8  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3381  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  36.36 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  43.1 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>