23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1353 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1353  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  31.54 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  34.09 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  27.39 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  27.74 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  27.39 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.48 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2339  HPr kinase  25.66 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0970084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0851  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.54 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4906  HPr kinase  27.98 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0668062  normal  0.137945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  25.65 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  27.82 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1478  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  27.91 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  28.03 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.2 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  32.33 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5037  HPr kinase  25.32 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  27.37 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  32.33 
 
 		 361 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3244  HPr kinase  24.15 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  34.44 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0872  HPr kinase  34.86 
 
 		 347 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>