20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4502 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4502  HPr kinase  100 
 
 
313 aa  632  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2830  HPr kinase  44.44 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2954  HPr kinase  30.9 
 
 
329 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3385  HPr kinase  27.8 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.448245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3026  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  31.67 
 
 
340 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2827  hypothetical protein  29.63 
 
 
341 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.35 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  35.63 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0966  hypothetical protein  51.11 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  27.55 
 
 
301 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2007  HPr kinase  35.37 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0853  hypothetical protein  42.86 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  47.37 
 
 
608 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1964  HPr kinase  34.62 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4549  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  26.82 
 
 
323 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.123281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0316  HPr kinase  38.16 
 
 
142 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2661  hypothetical protein  51.16 
 
 
296 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0700919  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  26.32 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24640  hypothetical protein  42.86 
 
 
250 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  52.63 
 
 
624 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>