15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1918 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1918  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  532  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  27.6 
 
 
288 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1280  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  34.78 
 
 
323 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  29.41 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  26.92 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  25.82 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05500  hypothetical protein  31.49 
 
 
379 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
1596 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  38.1 
 
 
301 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  26.37 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  27.07 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1352  hypothetical protein  38.81 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1025  HPr kinase  46.03 
 
 
322 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.205108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3276  HPr kinase  31.4 
 
 
316 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  31.87 
 
 
404 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>