8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3877 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3877  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3875  hypothetical protein  27.37 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2830  hypothetical protein  27.01 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2560  hypothetical protein  24.2 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24640  hypothetical protein  29.03 
 
 		 250 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2321  HPr kinase  22.38 
 
 		 364 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1217  HPr kinase  35.71 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0169089  normal  0.100415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2373  HPr kinase  28 
 
 		 305 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>