62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02390 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  100 
 
 		 209 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  65.35 
 
 		 209 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  64.67 
 
 		 256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  61.75 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  59.26 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  59.88 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  63.16 
 
 		 295 aa  201  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  56.1 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  60.21 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  52.6 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  56.41 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  66.67 
 
 		 226 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  55.49 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  66.67 
 
 		 226 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  66.67 
 
 		 226 aa  195  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  53.48 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  60 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2085  hypothetical protein  62.84 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  56.76 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  58.05 
 
 		 258 aa  185  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  64.58 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  64.58 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  52.72 
 
 		 213 aa  178  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  60.44 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  52.43 
 
 		 249 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  58.79 
 
 		 244 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  58.82 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  53.73 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  51.43 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  55.49 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  38.33 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  36.14 
 
 		 211 aa  128  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  37.17 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  34.04 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  32.98 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  34.59 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  35.22 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  34.59 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  34.59 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  34.59 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  34.59 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  34.59 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  34.59 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  34.59 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  29.59 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  24.61 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  24.61 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  25.68 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  23.16 
 
 		 306 aa  61.2  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  30.05 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  28.33 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  28.89 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  27.78 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  27.22 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  27.01 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  27.22 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  26.46 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0830  hypothetical protein  23.71 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  22.4 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1048  hypothetical protein  25.98 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.864097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>