62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3372 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  77.62 
 
 		 227 aa  304  7e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  58.57 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  62.44 
 
 		 238 aa  221  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  59.15 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  57.75 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  59.36 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  58.06 
 
 		 209 aa  178  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  49.21 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  55.68 
 
 		 203 aa  175  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  175  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  51.32 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  50.8 
 
 		 206 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  52.6 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  58.82 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  55.38 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  53.85 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  53.33 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  48.11 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  55.9 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2085  hypothetical protein  56.68 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  57.75 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  58.08 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  58.08 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  58.08 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  52 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  57.22 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  51.6 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  48.15 
 
 		 213 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  41.08 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  44.57 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  36 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  40.12 
 
 		 211 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  35.64 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  31.89 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  33.86 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  32.28 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  32.62 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  32.09 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  32.09 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  31.55 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  31.55 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  31.55 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  31.55 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  23.27 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  24.12 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  23.62 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  32.45 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  30.52 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  29.05 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  25.56 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  25.56 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  26.11 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  25.56 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  25.56 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  26.78 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  27.32 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  27.42 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0973  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0948172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  25.82 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1765  hypothetical protein  23.3 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0161759 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  23.96 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>