71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3343 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
219 aa  421  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  48.43 
 
 
234 aa  198  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  53.23 
 
 
228 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  56.67 
 
 
256 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  54.95 
 
 
203 aa  184  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  57.92 
 
 
295 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  54.44 
 
 
209 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  55.45 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  55.45 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  55.45 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  47.37 
 
 
287 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  52.07 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  52.22 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2085  hypothetical protein  60.11 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  54.14 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  46.67 
 
 
227 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  51.4 
 
 
244 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  51.91 
 
 
214 aa  171  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  47.2 
 
 
220 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  59.67 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  52.22 
 
 
224 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  45.58 
 
 
249 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  52.58 
 
 
217 aa  158  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  54.75 
 
 
218 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  54.75 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  51.23 
 
 
258 aa  151  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  44.19 
 
 
213 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  53.33 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  53.18 
 
 
241 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  47.98 
 
 
213 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  41.85 
 
 
222 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  33.01 
 
 
225 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  40.78 
 
 
211 aa  121  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  34.69 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  33.33 
 
 
218 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  31.11 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  31.11 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  31.11 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  31.11 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  31.11 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  33.96 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  23.86 
 
 
306 aa  71.6  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  32.08 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  24.74 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  24.74 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  29.38 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  24 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  24 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  26.87 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  25.13 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  23.3 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  23.5 
 
 
221 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  27.04 
 
 
224 aa  52  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  23.98 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  23.88 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  25.29 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  26.78 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5425  hypothetical protein  23.16 
 
 
208 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0316019  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5526  hypothetical protein  23.16 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5084  permease  22.7 
 
 
208 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5101  permease  22.7 
 
 
208 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5532  hypothetical protein  23.16 
 
 
208 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277764  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1765  hypothetical protein  26 
 
 
214 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0161759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5196  hypothetical protein  22.92 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0225091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5582  hypothetical protein  23.24 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5498  hypothetical protein  22.7 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5653  hypothetical protein  22.7 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5255  hypothetical protein  22.7 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  25.25 
 
 
212 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>