56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3401 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
241 aa  447  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  55.71 
 
 
234 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  56.77 
 
 
256 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  57.81 
 
 
228 aa  191  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  58.64 
 
 
209 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  47.14 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  53.68 
 
 
206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  53.67 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  51.18 
 
 
214 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  51.61 
 
 
234 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  55.35 
 
 
220 aa  178  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  54.55 
 
 
227 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  53.73 
 
 
203 aa  175  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  61.05 
 
 
226 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  53.08 
 
 
238 aa  169  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  61.05 
 
 
226 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  61.05 
 
 
226 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2085  hypothetical protein  57.37 
 
 
233 aa  168  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  45.87 
 
 
258 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  52.78 
 
 
244 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  52.48 
 
 
224 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  59.07 
 
 
218 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  59.07 
 
 
218 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  55.9 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  49.19 
 
 
213 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  52.72 
 
 
219 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  55.85 
 
 
209 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  48.62 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  43.43 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  50.52 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  38.01 
 
 
225 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  38.92 
 
 
211 aa  108  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  35.83 
 
 
249 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  31.84 
 
 
222 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  33.49 
 
 
218 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  28.11 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  29.19 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  29.19 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  29.19 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  29.19 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  30.56 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  28.65 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  29.46 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  29.51 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  31.1 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  28.89 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  29.19 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  27.75 
 
 
214 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  27.75 
 
 
214 aa  55.1  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  24.34 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  25.81 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1768  hypothetical protein  27.85 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  26.88 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  25.81 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  23.61 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  23.61 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>