64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12710 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  100 
 
 
249 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  47.56 
 
 
256 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  44.93 
 
 
227 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  46.96 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  49.73 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  47.2 
 
 
295 aa  158  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  45.75 
 
 
220 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  50.86 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  47.75 
 
 
209 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  45.07 
 
 
238 aa  151  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2085  hypothetical protein  48.65 
 
 
233 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  51.1 
 
 
217 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  46.67 
 
 
226 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  46.67 
 
 
226 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  46.67 
 
 
226 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  45.58 
 
 
219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  41.01 
 
 
228 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  43.3 
 
 
287 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  48.11 
 
 
228 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  43.06 
 
 
213 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  45.6 
 
 
203 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  44.32 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  44.27 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  40.39 
 
 
214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  44.86 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  52.43 
 
 
209 aa  128  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  32.56 
 
 
222 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  47.59 
 
 
218 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  43.43 
 
 
241 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  47.06 
 
 
218 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  35.78 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  38.86 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  37.08 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  35.35 
 
 
218 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  32.81 
 
 
249 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  30.86 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  30.86 
 
 
212 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  30.29 
 
 
212 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  30.29 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  30.29 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  30.29 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  30.86 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  30.29 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  29.05 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  23.7 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  29.68 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  27.89 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  25.88 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  24.89 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  21.81 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5101  permease  22.36 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239708  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  25.97 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5196  hypothetical protein  23.6 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0225091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  22.67 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  21.51 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5084  permease  21.74 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5532  hypothetical protein  22.22 
 
 
208 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277764  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5526  hypothetical protein  22.36 
 
 
208 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5425  hypothetical protein  22.36 
 
 
208 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0316019  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  22.67 
 
 
221 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5582  hypothetical protein  22.84 
 
 
208 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00443539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5653  hypothetical protein  21.74 
 
 
208 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5498  hypothetical protein  21.74 
 
 
208 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5255  hypothetical protein  21.74 
 
 
208 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>