131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0288 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0288  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00767163  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0061  50S ribosomal protein L23  70 
 
 		 93 aa  140  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000483414  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0036  50S ribosomal protein L23  67.78 
 
 		 93 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00020756  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1702  50S ribosomal protein L23  65.56 
 
 		 93 aa  134  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000496686  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2079  50S ribosomal protein L23  65.56 
 
 		 93 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000138255  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1966  50S ribosomal protein L23  65.93 
 
 		 93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1873  50S ribosomal protein L23  65.56 
 
 		 93 aa  133  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0703084  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1030  50S ribosomal protein L23  64.44 
 
 		 93 aa  133  8e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000430849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0353  50S ribosomal protein L23  63.33 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000019966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0086  50S ribosomal protein L23  63.04 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00130927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  37.08 
 
 		 113 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  36.14 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  34.94 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  34.94 
 
 		 97 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  34.94 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  31.33 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  35.8 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  37.66 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  33.33 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  34.94 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  34.94 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  37.66 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  32.61 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  34.18 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  34.18 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  34.18 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  36.59 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000131875  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  31.17 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  31.33 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  33.73 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  29.73 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  32.91 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  32.1 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  30.95 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  34.83 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  34.29 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  29.03 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0610  50S ribosomal protein L23  35.44 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  31.65 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  31.58 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  32.91 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  32.91 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  28.92 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  28.92 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  32 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  32.91 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0411  50S ribosomal protein L23  32.95 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.727367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  32.14 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  31.65 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  32 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  30.26 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  29.11 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0428  50S ribosomal protein L23  30.59 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291057  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  29.67 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  31.08 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  32.91 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  28.95 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  29.47 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  27.91 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  28.41 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  31.46 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  27.85 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  27.85 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  30.38 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  29.47 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  28.95 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  30.95 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  27.85 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  29.89 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  30.95 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  34.52 
 
 		 103 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  28.57 
 
 		 100 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  30.68 
 
 		 94 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  27.5 
 
 		 96 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  29.89 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  28.57 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  28.95 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  28.57 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  28.57 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  27.03 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  30.85 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2838  50S ribosomal protein L23  30.38 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000238806  normal  0.241874 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  28.92 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0491  50S ribosomal protein L23  32.35 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310283  hitchhiker  0.00323784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0486  50S ribosomal protein L23  32.35 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000945976  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  28.38 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  28.38 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  28.38 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000795974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>