113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1966 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1966  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 93 aa  187  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0061  50S ribosomal protein L23  73.12 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000483414  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0036  50S ribosomal protein L23  74.19 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00020756  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2079  50S ribosomal protein L23  74.19 
 
 		 93 aa  140  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000138255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1702  50S ribosomal protein L23  74.19 
 
 		 93 aa  140  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000496686  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1030  50S ribosomal protein L23  70.97 
 
 		 93 aa  140  8e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000430849  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0086  50S ribosomal protein L23  73.12 
 
 		 93 aa  138  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00130927  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1873  50S ribosomal protein L23  72.04 
 
 		 93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0703084  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0353  50S ribosomal protein L23  67.74 
 
 		 93 aa  137  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000019966  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0288  50S ribosomal protein L23  65.93 
 
 		 93 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00767163  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  37.35 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  38.55 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  30.12 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  36.71 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  35.44 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  39.02 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  35.44 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  34.18 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  37.66 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  34.18 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  37.66 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  35 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  33.33 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  34.18 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  34.18 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  34.94 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  34.94 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  34.57 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  32.14 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0411  50S ribosomal protein L23  39.24 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.727367  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0428  50S ribosomal protein L23  34.83 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291057  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0491  50S ribosomal protein L23  33.71 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310283  hitchhiker  0.00323784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0486  50S ribosomal protein L23  33.71 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000945976  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  33.78 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  33.78 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  33.78 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0610  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  36.14 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0160  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  decreased coverage  0.0000412321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  33.75 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4315  50S ribosomal protein L23  35.29 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000209174  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1416  ribosomal protein L25/L23  37.36 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  32.91 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000795974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000251497  unclonable  0.00000770372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4688  50S ribosomal protein L23  35.29 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000001343  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000001282  unclonable  0.00000000000566696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0268  ribosomal protein L23  34.12 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.00000000000690365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  34.52 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000118285  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  33.77 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  33.73 
 
 		 100 aa  43.9  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  31.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000698801  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3999  50S ribosomal protein L23  32.14 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  32.43 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  35.9 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000131875  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  32.61 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3820  50S ribosomal protein L23  32.14 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000460172  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  32.53 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  31.33 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>