More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1665 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02950  2,4-dienoyl-CoA reductase, NADH and FMN-linked  62.18 
 
 		 672 aa  858    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0620  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.18 
 
 		 672 aa  858    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3517  2,4-dienoyl-CoA reductase  62.33 
 
 		 672 aa  860    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1562  2,4-dienoyl-CoA reductase  59.82 
 
 		 677 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.86 
 
 		 725 aa  707    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.824421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.46 
 
 		 693 aa  909    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3263  2,4-dienoyl-CoA reductase  62.33 
 
 		 672 aa  859    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2300  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.63 
 
 		 671 aa  816    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3539  2,4-dienoyl-CoA reductase  60.36 
 
 		 673 aa  834    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4577  2,4-dienoyl-CoA reductase  55.82 
 
 		 668 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1515  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.23 
 
 		 686 aa  751    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0925  2,4-dienoyl-CoA reductase  58.97 
 
 		 680 aa  816    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2449  2,4-dienoyl-CoA reductase  60.68 
 
 		 674 aa  824    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.980511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1665  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 		 672 aa  1385    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2419  2,4-dienoyl-CoA reductase, putative  55.95 
 
 		 672 aa  804    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3480  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  60.24 
 
 		 672 aa  831    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3548  2,4-dienoyl-CoA reductase  62.48 
 
 		 672 aa  861    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3803  2,4-dienoyl-CoA reductase  65.13 
 
 		 679 aa  897    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0921105  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0192  2,4-dienoyl-CoA reductase  59.82 
 
 		 677 aa  833    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.804371  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5306  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.07 
 
 		 678 aa  646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0503962  normal  0.110792 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2296  hypothetical protein  57.51 
 
 		 674 aa  789    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2269  hypothetical protein  57.21 
 
 		 674 aa  785    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2056  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.8 
 
 		 672 aa  796    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000710375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase:FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  65.13 
 
 		 679 aa  903    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2848  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.95 
 
 		 684 aa  843    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3410  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  60.24 
 
 		 672 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0181  2,4-dienoyl-CoA reductase  50.72 
 
 		 711 aa  691    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11200  NADPH dependent 2,4-dienoyl-CoA reductase fadH  55.11 
 
 		 674 aa  759    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.248388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3734  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.57 
 
 		 678 aa  899    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.658826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2575  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  59.97 
 
 		 677 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.34 
 
 		 673 aa  889    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0711436  hitchhiker  0.000184584 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6110  2,4-dienoyl-CoA reductase  50.07 
 
 		 676 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02526  2,4-dienoyl-CoA reductase  56.14 
 
 		 679 aa  790    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1598  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  62.54 
 
 		 673 aa  874    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.68 
 
 		 671 aa  828    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00189686  normal  0.0287247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4309  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.05 
 
 		 673 aa  833    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.467576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0094  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  62.54 
 
 		 673 aa  876    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0995  2,4-dienoyl-CoA reductase  59.82 
 
 		 677 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1540  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.01 
 
 		 678 aa  903    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871647  normal  0.815252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1578  2,4-dienoyl-CoA reductase  55.61 
 
 		 684 aa  772    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000245004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3687  2,4-dienoyl-CoA reductase  65.29 
 
 		 679 aa  924    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2252  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.33 
 
 		 671 aa  814    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0819924  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2719  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  59.97 
 
 		 677 aa  833    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2943  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  86.61 
 
 		 672 aa  1170    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.1 
 
 		 672 aa  802    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000937343  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.27 
 
 		 677 aa  837    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534783  normal  0.598591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03303  2,4-dienoyl-CoA reductase  61.4 
 
 		 680 aa  858    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4477  2,4-dienoyl-CoA reductase  62.61 
 
 		 674 aa  869    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1568  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  67.01 
 
 		 678 aa  904    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.191366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2335  2,4-dienoyl-CoA reductase  60.27 
 
 		 677 aa  845    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0619  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.18 
 
 		 672 aa  858    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2663  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.13 
 
 		 701 aa  762    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.838271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0501  2,4-dienoyl-coa reductase  61.01 
 
 		 673 aa  829    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3514  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  60.39 
 
 		 672 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0478  2,4-dienoyl-CoA reductase  60.12 
 
 		 689 aa  835    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523998  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1273  2,4-dienoyl-CoA reductase  62.84 
 
 		 722 aa  872    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.988489  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3639  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.97 
 
 		 677 aa  836    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.664149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1799  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.7 
 
 		 681 aa  702    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.921787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1891  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.49 
 
 		 832 aa  875    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5274  2,4-dienoyl-CoA reductase  50.74 
 
 		 682 aa  664    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000012986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1367  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  59.82 
 
 		 677 aa  833    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.428075  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1452  2,4-dienoyl-CoA reductase  54.12 
 
 		 681 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148373 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4232  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.65 
 
 		 683 aa  814    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.44 
 
 		 671 aa  806    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000127564  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1515  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  62.24 
 
 		 673 aa  872    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0916177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0879  2,4-dienoyl-CoA reductase  56.59 
 
 		 670 aa  790    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5533  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  55.51 
 
 		 681 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0194  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.65 
 
 		 711 aa  693    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2074  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  65.63 
 
 		 687 aa  924    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.985968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2077  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.61 
 
 		 672 aa  786    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100681  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2458  2,4-dienoyl-CoA reductase  58.81 
 
 		 675 aa  822    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0863  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.02 
 
 		 674 aa  863    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.32 
 
 		 677 aa  832    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4599  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.12 
 
 		 677 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1323  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.72 
 
 		 674 aa  859    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1371  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  65.48 
 
 		 682 aa  893    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0728118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2400  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.9 
 
 		 692 aa  839    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2046  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH1  65.53 
 
 		 679 aa  892    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22113  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1910  2,4-dienoyl-CoA reductase  55.8 
 
 		 672 aa  806    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000568451  hitchhiker  0.00000446826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2068  2,4-dienoyl-CoA reductase  55.95 
 
 		 672 aa  808    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000747876  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2144  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.18 
 
 		 671 aa  819    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000426277  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0563  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.01 
 
 		 673 aa  830    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4270  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.03 
 
 		 673 aa  892    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5493  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.12 
 
 		 677 aa  838    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.810441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0797  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.09 
 
 		 676 aa  829    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369713  normal  0.316653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24170  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH1  65.23 
 
 		 679 aa  887    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63640  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  55.8 
 
 		 681 aa  766    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.771531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0125  NADPH:2,4-dienoyl-CoA reductase  59.46 
 
 		 672 aa  805    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  55.13 
 
 		 670 aa  768    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3375  2,4-dienoyl-CoA reductase  61.88 
 
 		 672 aa  850    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1344  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.02 
 
 		 674 aa  863    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3764  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.12 
 
 		 677 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.864752  normal  0.239424 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1093  2,4-dienoyl-CoA reductase  61.01 
 
 		 673 aa  830    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2310  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.23 
 
 		 671 aa  828    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00279391  hitchhiker  0.0000579308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2951  2,4-dienoyl-CoA reductase  66.03 
 
 		 677 aa  940    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1965  2,4-dienoyl-CoA reductase  55.8 
 
 		 672 aa  804    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0338968  hitchhiker  0.00188672 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2410  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.95 
 
 		 672 aa  798    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000608727  unclonable  0.0000147486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1942  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.48 
 
 		 671 aa  812    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000878087  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01164  2,4-dienoyl-CoA reductase  65.53 
 
 		 680 aa  888    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0222  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  59.82 
 
 		 677 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>