More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3517 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02950  2,4-dienoyl-CoA reductase, NADH and FMN-linked  98.96 
 
 		 672 aa  1369    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0620  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  98.96 
 
 		 672 aa  1369    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2575  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  60.15 
 
 		 677 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0222  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  60 
 
 		 677 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3517  2,4-dienoyl-CoA reductase  100 
 
 		 672 aa  1385    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.54 
 
 		 693 aa  845    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3734  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.39 
 
 		 678 aa  844    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.658826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3410  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  85.71 
 
 		 672 aa  1204    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2074  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.74 
 
 		 687 aa  897    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.985968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2077  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.68 
 
 		 672 aa  773    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2410  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.59 
 
 		 672 aa  772    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000608727  unclonable  0.0000147486 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.27 
 
 		 671 aa  787    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00189686  normal  0.0287247 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1515  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  63.99 
 
 		 673 aa  881    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0916177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0925  2,4-dienoyl-CoA reductase  57.23 
 
 		 680 aa  800    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2449  2,4-dienoyl-CoA reductase  60.42 
 
 		 674 aa  832    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.980511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1665  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.33 
 
 		 672 aa  819    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2419  2,4-dienoyl-CoA reductase, putative  56.97 
 
 		 672 aa  790    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3263  2,4-dienoyl-CoA reductase  99.7 
 
 		 672 aa  1379    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3803  2,4-dienoyl-CoA reductase  63.49 
 
 		 679 aa  838    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0921105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1578  2,4-dienoyl-CoA reductase  56.48 
 
 		 684 aa  770    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000245004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4309  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.34 
 
 		 673 aa  932    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.467576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3375  2,4-dienoyl-CoA reductase  98.07 
 
 		 672 aa  1358    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0192  2,4-dienoyl-CoA reductase  60 
 
 		 677 aa  820    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.804371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0619  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  98.96 
 
 		 672 aa  1369    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2296  hypothetical protein  57.12 
 
 		 674 aa  788    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2269  hypothetical protein  56.97 
 
 		 674 aa  787    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase:FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  64.23 
 
 		 679 aa  847    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.592508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  57.08 
 
 		 670 aa  778    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0181  2,4-dienoyl-CoA reductase  47.91 
 
 		 711 aa  655    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126042 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1093  2,4-dienoyl-CoA reductase  72.47 
 
 		 673 aa  1008    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1799  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.29 
 
 		 681 aa  701    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.921787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3639  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60 
 
 		 677 aa  817    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.664149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6110  2,4-dienoyl-CoA reductase  52.23 
 
 		 676 aa  693    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1568  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.4 
 
 		 678 aa  842    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.191366 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5306  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.44 
 
 		 678 aa  642    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0503962  normal  0.110792 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0094  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  64.14 
 
 		 673 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0995  2,4-dienoyl-CoA reductase  60 
 
 		 677 aa  819    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497103  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02526  2,4-dienoyl-CoA reductase  58.17 
 
 		 679 aa  749    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3687  2,4-dienoyl-CoA reductase  63.02 
 
 		 679 aa  858    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2252  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  54.95 
 
 		 671 aa  777    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0819924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03303  2,4-dienoyl-CoA reductase  58.93 
 
 		 680 aa  816    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3759  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60 
 
 		 677 aa  822    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534783  normal  0.598591 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1562  2,4-dienoyl-CoA reductase  60 
 
 		 677 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0797  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.39 
 
 		 676 aa  779    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369713  normal  0.316653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3480  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  86.01 
 
 		 672 aa  1203    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2719  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  60.15 
 
 		 677 aa  821    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4477  2,4-dienoyl-CoA reductase  65.32 
 
 		 674 aa  887    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5533  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  54.38 
 
 		 681 aa  719    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2335  2,4-dienoyl-CoA reductase  59.62 
 
 		 677 aa  826    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1540  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.8 
 
 		 678 aa  835    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.871647  normal  0.815252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3514  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  86.16 
 
 		 672 aa  1205    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185264 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3548  2,4-dienoyl-CoA reductase  99.26 
 
 		 672 aa  1373    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4577  2,4-dienoyl-CoA reductase  53.65 
 
 		 668 aa  698    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2663  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.79 
 
 		 701 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.838271 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0478  2,4-dienoyl-CoA reductase  60.59 
 
 		 689 aa  826    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.523998  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1367  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide domain-containing oxidoreductase  60 
 
 		 677 aa  820    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.428075  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1273  2,4-dienoyl-CoA reductase  65.03 
 
 		 722 aa  888    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.988489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2943  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.98 
 
 		 672 aa  822    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3539  2,4-dienoyl-CoA reductase  84.63 
 
 		 673 aa  1188    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1891  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  63.45 
 
 		 832 aa  882    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5274  2,4-dienoyl-CoA reductase  51.78 
 
 		 682 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000012986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0563  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  72.47 
 
 		 673 aa  1008    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1452  2,4-dienoyl-CoA reductase  52.13 
 
 		 681 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2300  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  55.56 
 
 		 671 aa  780    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1900  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.23 
 
 		 671 aa  782    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000127564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1942  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.68 
 
 		 671 aa  783    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000878087  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0879  2,4-dienoyl-CoA reductase  57.21 
 
 		 670 aa  770    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2310  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.44 
 
 		 671 aa  791    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00279391  hitchhiker  0.0000579308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0194  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.42 
 
 		 711 aa  661    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2951  2,4-dienoyl-CoA reductase  63 
 
 		 677 aa  867    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140431 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2458  2,4-dienoyl-CoA reductase  60.27 
 
 		 675 aa  830    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0863  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  65.07 
 
 		 674 aa  885    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1337  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  61.48 
 
 		 673 aa  852    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0711436  hitchhiker  0.000184584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4599  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.7 
 
 		 677 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2110  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.22 
 
 		 725 aa  686    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.824421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1371  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  62.63 
 
 		 682 aa  855    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0728118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2400  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  58.69 
 
 		 692 aa  804    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11200  NADPH dependent 2,4-dienoyl-CoA reductase fadH  52.52 
 
 		 674 aa  693    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.248388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1515  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.32 
 
 		 686 aa  695    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2056  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.19 
 
 		 672 aa  768    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000710375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1910  2,4-dienoyl-CoA reductase  57.19 
 
 		 672 aa  794    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000568451  hitchhiker  0.00000446826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2068  2,4-dienoyl-CoA reductase  57.19 
 
 		 672 aa  794    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000747876  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2144  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.23 
 
 		 671 aa  801    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000426277  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4232  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.71 
 
 		 683 aa  785    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0125  NADPH:2,4-dienoyl-CoA reductase  57.78 
 
 		 672 aa  755    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2848  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.23 
 
 		 684 aa  749    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5493  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60 
 
 		 677 aa  818    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.810441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24170  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH1  61.96 
 
 		 679 aa  834    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01164  2,4-dienoyl-CoA reductase  63.38 
 
 		 680 aa  856    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63640  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  54.17 
 
 		 681 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.771531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.47 
 
 		 677 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0501  2,4-dienoyl-coa reductase  72.62 
 
 		 673 aa  1014    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1598  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  64.14 
 
 		 673 aa  880    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1344  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  65.07 
 
 		 674 aa  885    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3764  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.7 
 
 		 677 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.864752  normal  0.239424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2046  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH1  62.11 
 
 		 679 aa  838    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1323  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.93 
 
 		 674 aa  882    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.19 
 
 		 672 aa  767    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000937343  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1965  2,4-dienoyl-CoA reductase  56.68 
 
 		 672 aa  790    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0338968  hitchhiker  0.00188672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4822  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  60.57 
 
 		 669 aa  838    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>