298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0471 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0471  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 104 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  39.18 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  38.3 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  38.3 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5143  integrase catalytic subunit  32.67 
 
 		 512 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.1652 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3970  transposase IS3/IS911 family protein  38.55 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1213  transposase and inactivated derivative  43.75 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1750  integrase catalytic subunit  32.98 
 
 		 462 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  32.67 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3958  transposase IS3/IS911 family protein  37.35 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.98909  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3981  transposase IS3/IS911 family protein  37.35 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403658  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4090  transposase IS3/IS911 family protein  37.35 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0406  transposase IS3/IS911 family protein  37.35 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0212224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0647  transposase IS3/IS911 family protein  37.35 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1000  transposase IS3/IS911 family protein  37.35 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  31.07 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  35.11 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  33.33 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  35.11 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  34.31 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  34.31 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  34.31 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  34.31 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  34.31 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  32.97 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  32.97 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  32.97 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1714  putative transposase  33.68 
 
 		 513 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  33.66 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  34.31 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  35.79 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  35.79 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  35.79 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  35.79 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  35.79 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  32.04 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  37.35 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  37.35 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  34.04 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0339  integrase catalytic subunit  34.38 
 
 		 515 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  33.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  33.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  37.37 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  33.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  33.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  33.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  30.21 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2556  transposase IS3/IS911 family protein  32.67 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  33.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  33.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  33.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  33.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  33.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  33.66 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3440  integrase catalytic region  26.73 
 
 		 533 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.257291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0439  transposase  34.74 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  33.33 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  31.87 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  33.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  33 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  33 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  33 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3351  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 133 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1685  ISCps9, transposase orfA  32.63 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.667855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2858  ISCps9, transposase orfA  32.63 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2963  ISCps9, transposase orfA  32.63 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3121  ISCps9, transposase orfA  32.63 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  33.33 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  32.32 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  30.85 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  30.85 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  30.85 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  30.85 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  30.85 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>