76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2963 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1685  ISCps9, transposase orfA  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.667855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2858  ISCps9, transposase orfA  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2963  ISCps9, transposase orfA  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3121  ISCps9, transposase orfA  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0895  ISCps3, transposase orfA  50.41 
 
 		 120 aa  116  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0924091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2959  ISCps3, transposase orfA  50.41 
 
 		 120 aa  116  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0349684  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2388  transposase IS3/IS911 family protein  58.93 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.914179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  36.63 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  33.33 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  36.08 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  36.08 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  36.08 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1796  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  36.17 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  30.69 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  30.69 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  30.69 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0471  transposase IS3/IS911  32.63 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3600  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  33.66 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0339  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0453  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0841  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1031  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1104  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3275  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3731  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.748336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4160  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4228  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4249  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4971  transposase IS3/IS911 family protein  30.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C60  transposase  35.11 
 
 		 357 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  30.21 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  30.21 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  32.29 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2003  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  35.11 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  35.11 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  35.11 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  35.11 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  35.11 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  35.11 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  35.11 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1944  transposase IS3/IS911 family protein  29.79 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  32.22 
 
 		 103 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0237  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  32.29 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  32.29 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1213  transposase and inactivated derivative  36.25 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  30.21 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  31.25 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0082  transposase  30.84 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.76598 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0012  transposase  30.84 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.671169  normal  0.107805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2410  ISCps2, transposase orfA  36.56 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0595959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>