63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2959 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0895  ISCps3, transposase orfA  100 
 
 		 120 aa  245  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0924091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2959  ISCps3, transposase orfA  100 
 
 		 120 aa  245  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0349684  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2388  transposase IS3/IS911 family protein  91.89 
 
 		 74 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.914179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1685  ISCps9, transposase orfA  50.41 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.667855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3121  ISCps9, transposase orfA  50.41 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2963  ISCps9, transposase orfA  50.41 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2858  ISCps9, transposase orfA  50.41 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  39.36 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  32.63 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1672  transposase  31.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1086  transposase  31.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1037  transposase  31.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0883  transposase  31.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.453287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0855  transposase  31.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000259877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0849  transposase  31.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00575778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0664  transposase  31.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C60  transposase  34.74 
 
 		 357 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1412  transposase  34.74 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000502951  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  34.62 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  35.35 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  35.35 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  38.78 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  32.63 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  32.63 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  33.67 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  33.67 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  33.67 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  32.63 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  32.63 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  32.08 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3778  integrase catalytic subunit  44.19 
 
 		 386 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3742  transposase IS3/IS911 family protein  32.38 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0576  transposase IS3/IS911 family protein  32.38 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0318  transposase  34.69 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.199253  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  33.72 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  35.71 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4144  transposase IS3/IS911 family protein  32.04 
 
 		 99 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0778  transposase IS3/IS911 family protein  32.04 
 
 		 99 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1962  transposase IS3/IS911 family protein  32.04 
 
 		 99 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2280  transposase IS3/IS911 family protein  32.04 
 
 		 99 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2381  transposase IS3/IS911 family protein  32.04 
 
 		 99 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3165  transposase IS3/IS911 family protein  32.04 
 
 		 99 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.011268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0471  transposase IS3/IS911  34.95 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  37.76 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  37.76 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  37.76 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  36.84 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  36.84 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  33.65 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  33.65 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  33.65 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  32.56 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0235  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  30.53 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  30.53 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  29.47 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  35.35 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  35.35 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  35.35 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  35.35 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  35.35 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1394  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 99 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2886  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 99 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>