14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2388 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2388  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 74 aa  153  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.914179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0895  ISCps3, transposase orfA  91.89 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0924091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2959  ISCps3, transposase orfA  91.89 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0349684  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1685  ISCps9, transposase orfA  58.93 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.667855  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2858  ISCps9, transposase orfA  58.93 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2963  ISCps9, transposase orfA  58.93 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3121  ISCps9, transposase orfA  58.93 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  42.86 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  46.34 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  44.74 
 
 		 96 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3778  integrase catalytic subunit  41.86 
 
 		 386 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>