160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5937 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 102 aa  207  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4204  transposase IS3/IS911 family protein  79.41 
 
 		 102 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1736  transposase  78.43 
 
 		 102 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0202  putative transposase  72.82 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1692  transposase  72.82 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4376  transposase IS3/IS911  64.08 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4500  transposase IS3/IS911 family protein  64.08 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1611  IS3 family transposase orfA  70.87 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1306  transposase IS3/IS911  62 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1654  transposase IS3/IS911  62 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1712  transposase IS3/IS911  62 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2284  transposase IS3/IS911  62 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1457  hypothetical protein  63.95 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08182  transposase  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000279853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01093  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01502  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01667  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01863  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01947  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02147  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02413  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02814  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02887  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05620  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05649  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05659  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05741  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05751  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06015  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06081  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06182  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  53.85 
 
 		 96 aa  106  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08186  transposase  52.75 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.0000609698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02326  hypothetical protein  52.94 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3396  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 101 aa  95.9  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0019  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 101 aa  95.9  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6609  transposase and inactivated derivatives  74.58 
 
 		 63 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.580446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0082  transposase IS3/IS911 family protein  49.46 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0293  transposase IS3/IS911 family protein  49.46 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0976  transposase IS3/IS911 family protein  49.46 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.163321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1326  transposase IS3/IS911 family protein  49.46 
 
 		 94 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0172705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3075  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  49.47 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1539  transposase  50 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0203174  normal  0.231759 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  44.79 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2431  putative transposase  48.31 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0237  transposase IS3/IS911 family protein  44.21 
 
 		 94 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0136  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1881  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0185  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.204073  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6985  transposase IS3/IS911 family protein  46.32 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2729  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 97 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0078  transposase IS3/IS911 family protein  41.49 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  45.98 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3664  transposase IS3/IS911 family protein  48.42 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  46.24 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  46.24 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1894  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0939  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1305  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0773  transposase IS3/IS911 family protein  46.24 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1903  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1759  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  48.24 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3029  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0430  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0351  hypothetical protein  70.45 
 
 		 44 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1144  transposase IS3/IS911 family protein  40.7 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 		 382 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2105  transposase IS3/IS911 family protein  40.3 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4042  hypothetical protein  74.36 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  34.34 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 382 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 382 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 382 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2699  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1620  hypothetical protein  43.55 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.35757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1413  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0015724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2230  transposase IS3/IS911  31.25 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000508714 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0995  transposase IS3/IS911  27.66 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2562  transposase (class V)  36.49 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000129365  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 		 369 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  31.52 
 
 		 369 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  32.32 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  32.32 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  32.32 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2136  transposase IS3/IS911  32.32 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2772  transposase IS3/IS911  32.32 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>