51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3904 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  100 
 
 
216 aa  434  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  55.61 
 
 
254 aa  207  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  43.19 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  41.63 
 
 
298 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  37.73 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  38.6 
 
 
237 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  33.48 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  28.64 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  32.12 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0481  Nucleotidyltransferase, predicted  32.23 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  31.98 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  27.85 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0574  hypothetical protein  33.06 
 
 
358 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  30.56 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  33.33 
 
 
356 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  27.81 
 
 
336 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3808  hypothetical protein  32.19 
 
 
266 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  30.28 
 
 
271 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4228  hypothetical protein  27.64 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  34.33 
 
 
262 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  32.59 
 
 
270 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  31.14 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  26.71 
 
 
265 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1902  hypothetical protein  34.88 
 
 
273 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  28.37 
 
 
254 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  28.37 
 
 
254 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  24.16 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  29.85 
 
 
263 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  29.93 
 
 
263 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  29.63 
 
 
260 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  31.88 
 
 
271 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  32.93 
 
 
260 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  29.63 
 
 
260 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  29.63 
 
 
260 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  29.63 
 
 
260 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  29.63 
 
 
260 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  31.88 
 
 
270 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  29.63 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  31.88 
 
 
271 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  29.63 
 
 
260 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  28.4 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  31.88 
 
 
271 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  31.88 
 
 
270 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  31.88 
 
 
270 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  32.1 
 
 
270 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  28.4 
 
 
260 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  31.08 
 
 
237 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  22.7 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  26.15 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  32.1 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  30.19 
 
 
259 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>