49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0679 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  63.67 
 
 
270 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  63.67 
 
 
270 aa  321  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  63.3 
 
 
270 aa  321  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  63.71 
 
 
271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  62.93 
 
 
271 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  62.93 
 
 
271 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  58.33 
 
 
262 aa  288  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  58.85 
 
 
281 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  56.76 
 
 
262 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  58.51 
 
 
263 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  57.5 
 
 
263 aa  280  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  57.54 
 
 
254 aa  278  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  57.14 
 
 
254 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  53.56 
 
 
270 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  48.48 
 
 
273 aa  239  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  44.53 
 
 
258 aa  222  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  42.23 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  42.23 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  42.06 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  41.83 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  41.83 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  41.67 
 
 
260 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  41.83 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  41.25 
 
 
263 aa  218  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  41.83 
 
 
260 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  42.86 
 
 
259 aa  208  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1192  hypothetical protein  43.65 
 
 
259 aa  204  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  42.11 
 
 
237 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  40.62 
 
 
255 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  45.61 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  51.76 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  35.8 
 
 
258 aa  182  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  33.73 
 
 
260 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  32.09 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0487  Nucleotidyltransferase, predicted  32.8 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2851  Nucleotidyltransferase, predicted  26.42 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  31.72 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  30.28 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1947  nucleotidyltransferase-like  25.93 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  35.64 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  32.14 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  33.73 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  37.96 
 
 
364 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  32.48 
 
 
254 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  28.4 
 
 
258 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  28.19 
 
 
298 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4228  hypothetical protein  29.29 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>