14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3808 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3808  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  528  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0481  Nucleotidyltransferase, predicted  60.38 
 
 		 260 aa  299  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  46.37 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1072  hypothetical protein  42.91 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.042495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1902  hypothetical protein  39.39 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  30.04 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  29.39 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  30.4 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  32.19 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  31.54 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0390  hypothetical protein  40.86 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.525134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  28.79 
 
 		 336 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  28.89 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  29.69 
 
 		 364 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>