16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1902 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1902  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  528  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1072  hypothetical protein  53.18 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.042495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  50.19 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0481  Nucleotidyltransferase, predicted  44.91 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3808  hypothetical protein  39.92 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  35.25 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0390  hypothetical protein  37.7 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.525134  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  33.98 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  36.05 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  30.14 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  27.84 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  39.26 
 
 		 254 aa  52.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  29.17 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  27.6 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  36.89 
 
 		 356 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  27.89 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>