49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4672 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  100 
 
 
271 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  100 
 
 
271 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  98.89 
 
 
271 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  95.57 
 
 
270 aa  523  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  95.2 
 
 
270 aa  517  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  94.46 
 
 
270 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  66.41 
 
 
281 aa  339  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  62.31 
 
 
262 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  62.35 
 
 
262 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  62 
 
 
263 aa  309  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  63.91 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  62.93 
 
 
271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  59.69 
 
 
270 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  58.43 
 
 
254 aa  295  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  58.04 
 
 
254 aa  293  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  49.43 
 
 
273 aa  238  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  47.04 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  45.38 
 
 
259 aa  228  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  41.43 
 
 
263 aa  218  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  41.43 
 
 
260 aa  218  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1192  hypothetical protein  44.88 
 
 
259 aa  218  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  41.04 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  44.21 
 
 
258 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  43.29 
 
 
255 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  41.41 
 
 
237 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  40.73 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  49.1 
 
 
265 aa  192  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  35.38 
 
 
260 aa  171  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  32.61 
 
 
248 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0487  Nucleotidyltransferase, predicted  30.21 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2851  Nucleotidyltransferase, predicted  29.63 
 
 
358 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  30.26 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  30.32 
 
 
280 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1947  nucleotidyltransferase-like  33.54 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  36.67 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  33.83 
 
 
364 aa  53.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  36.36 
 
 
256 aa  52.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  32.3 
 
 
254 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  29.17 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  28.91 
 
 
298 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  31.88 
 
 
216 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  30 
 
 
237 aa  45.4  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>