50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_60660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  100 
 
 
270 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  64.29 
 
 
262 aa  332  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  63.16 
 
 
262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  60.08 
 
 
271 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  59.69 
 
 
271 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  59.69 
 
 
271 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  59.3 
 
 
270 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  59.3 
 
 
270 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  59.3 
 
 
270 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  51.35 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  57.78 
 
 
281 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  51.74 
 
 
263 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  53.2 
 
 
254 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  52.8 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  53.56 
 
 
271 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  47.52 
 
 
260 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  47.52 
 
 
260 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  49.55 
 
 
260 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  47.11 
 
 
260 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  47.11 
 
 
260 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  46.69 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  49.1 
 
 
260 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  47.11 
 
 
260 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  49.1 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  45.98 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  46.85 
 
 
263 aa  215  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  50 
 
 
258 aa  214  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  47.2 
 
 
259 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  47.3 
 
 
255 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1192  hypothetical protein  44.8 
 
 
259 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  43.59 
 
 
258 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  45.41 
 
 
237 aa  195  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  51.92 
 
 
265 aa  190  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  35.77 
 
 
260 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  40.44 
 
 
270 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  31.5 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0487  Nucleotidyltransferase, predicted  27.78 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  33.13 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2851  Nucleotidyltransferase, predicted  30.56 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1947  nucleotidyltransferase-like  28.9 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  34.97 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  32.59 
 
 
216 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  30.77 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  30.13 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  32.74 
 
 
237 aa  53.1  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  36.9 
 
 
356 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  34.31 
 
 
254 aa  52  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  31.13 
 
 
364 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  30.93 
 
 
298 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4228  hypothetical protein  30.64 
 
 
246 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>