42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3903 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  61.3 
 
 
256 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  50.58 
 
 
251 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4228  hypothetical protein  36.24 
 
 
246 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  35 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  31.29 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  30.56 
 
 
216 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  25.45 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  31.28 
 
 
298 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  29.3 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  26.45 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  29.33 
 
 
280 aa  55.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  30.77 
 
 
270 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  26.45 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  25.81 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  26.45 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  26.45 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  29.75 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  29.8 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  26.45 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  26.45 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  26.45 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  28.05 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  28.89 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  30.06 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  28.84 
 
 
270 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  24.55 
 
 
258 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  29.17 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  26.38 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  29.17 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  29.17 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  25.19 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  28.32 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  28.1 
 
 
262 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  30.13 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  28.4 
 
 
271 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  32.1 
 
 
356 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  28.21 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  28.35 
 
 
364 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  28.05 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1072  hypothetical protein  29.22 
 
 
264 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.042495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  30.5 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>