47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3841 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  554  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  54.05 
 
 
281 aa  259  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  49.43 
 
 
271 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  49.43 
 
 
271 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  49.43 
 
 
271 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  47.91 
 
 
270 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  48.48 
 
 
271 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  47.91 
 
 
270 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  46.86 
 
 
262 aa  228  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  47.15 
 
 
270 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  46.12 
 
 
263 aa  222  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  46.33 
 
 
263 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  44.57 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  40.54 
 
 
260 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  40.54 
 
 
260 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  46.36 
 
 
254 aa  218  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  46.36 
 
 
254 aa  218  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  40.15 
 
 
260 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  45.98 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  40.15 
 
 
260 aa  214  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  42.58 
 
 
255 aa  214  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  40.08 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  39.77 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  39.69 
 
 
260 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  43.36 
 
 
258 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  39.77 
 
 
260 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  39.38 
 
 
260 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  41.41 
 
 
259 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1192  hypothetical protein  42.97 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  39.83 
 
 
237 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  37.74 
 
 
263 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  42.24 
 
 
270 aa  185  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  42.74 
 
 
258 aa  185  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  45.28 
 
 
265 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  35.18 
 
 
260 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  34.43 
 
 
248 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0487  Nucleotidyltransferase, predicted  26.92 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2851  Nucleotidyltransferase, predicted  24.87 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1947  nucleotidyltransferase-like  30.36 
 
 
278 aa  63.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  33.55 
 
 
251 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  33.77 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  33.33 
 
 
364 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  29.35 
 
 
356 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  30 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  26.15 
 
 
216 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  30.5 
 
 
258 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  28.09 
 
 
280 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>