44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0283 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0283  YcgL  100 
 
 
258 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  52.55 
 
 
260 aa  279  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  51.76 
 
 
260 aa  276  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  51.76 
 
 
260 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  52.99 
 
 
260 aa  275  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  51.76 
 
 
260 aa  275  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  51.76 
 
 
260 aa  275  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  51.37 
 
 
260 aa  275  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  51.76 
 
 
260 aa  275  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  52.59 
 
 
260 aa  275  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  51.17 
 
 
255 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  49.42 
 
 
263 aa  268  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  49.61 
 
 
259 aa  261  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  52.16 
 
 
237 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  48.19 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  47.04 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  47.43 
 
 
271 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  46.64 
 
 
270 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  47.04 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  47.04 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  46.75 
 
 
263 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  46.61 
 
 
270 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  48.21 
 
 
263 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  47.95 
 
 
281 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1192  hypothetical protein  45.74 
 
 
259 aa  222  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  45.31 
 
 
254 aa  221  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  47.71 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  45.31 
 
 
262 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  50 
 
 
270 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  44 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  44.53 
 
 
271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  43.36 
 
 
273 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  41.18 
 
 
270 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  41.3 
 
 
265 aa  181  9.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  39.25 
 
 
260 aa  175  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  33.8 
 
 
248 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1947  nucleotidyltransferase-like  25.91 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0487  Nucleotidyltransferase, predicted  29.7 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2851  Nucleotidyltransferase, predicted  28.11 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  29.28 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  29.75 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  24.55 
 
 
258 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  24.16 
 
 
216 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  34.15 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>