49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0488 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  100 
 
 
263 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  94.3 
 
 
263 aa  510  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  70.12 
 
 
254 aa  362  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  69.72 
 
 
254 aa  360  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  65.22 
 
 
270 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  64.35 
 
 
270 aa  309  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  64.35 
 
 
271 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  63.91 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  63.91 
 
 
271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  63.48 
 
 
270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  60.16 
 
 
281 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  58.14 
 
 
262 aa  299  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  60.62 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  51.35 
 
 
270 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  57.5 
 
 
271 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  48.21 
 
 
258 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  43.32 
 
 
260 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  43.32 
 
 
260 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1192  hypothetical protein  47.18 
 
 
259 aa  221  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  42.69 
 
 
260 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  42.91 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  42.91 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  42.91 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  46.33 
 
 
273 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  42.29 
 
 
260 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  42.11 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  42.11 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  44.22 
 
 
259 aa  214  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  43.75 
 
 
258 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  42.97 
 
 
255 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  39.29 
 
 
263 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  42.15 
 
 
237 aa  198  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  43.3 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  36.72 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  44.09 
 
 
265 aa  166  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  29.48 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1947  nucleotidyltransferase-like  27.4 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0487  Nucleotidyltransferase, predicted  29.45 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  28.03 
 
 
251 aa  58.5  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3903  hypothetical protein  29.75 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2851  Nucleotidyltransferase, predicted  26.56 
 
 
358 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2873  hypothetical protein  31.45 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  34.15 
 
 
280 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  29.85 
 
 
216 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  32.94 
 
 
356 aa  48.5  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  35.63 
 
 
364 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  27.86 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4228  hypothetical protein  31.43 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>