15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0028 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  100 
 
 		 336 aa  685    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  27.64 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  29.64 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0574  hypothetical protein  25.14 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  35.33 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2518  Nucleotidyltransferase, predicted  32.06 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0207586  hitchhiker  0.00121784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1072  hypothetical protein  34.09 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.042495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  27.81 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1902  hypothetical protein  30.14 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  29.75 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0481  Nucleotidyltransferase, predicted  30.53 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  32 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  27.39 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3808  hypothetical protein  28.79 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  29.3 
 
 		 241 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>