12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0574 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0574  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  749    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  53.22 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1517  hypothetical protein  28.57 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000966752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0028  uncharacterized protein, YcgL-like protein  25.14 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  33.87 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  30.08 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  33.06 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0053  nucleotidyltransferase-like protein  32.26 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6191  hypothetical protein  34.43 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  41.67 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  31 
 
 		 251 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  32.18 
 
 		 265 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>