72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3305 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  283  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  65.12 
 
 
129 aa  189  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  67.72 
 
 
132 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  66.14 
 
 
132 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  67.72 
 
 
132 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  61.72 
 
 
128 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  63.78 
 
 
129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  63.78 
 
 
129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  63.78 
 
 
129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  63.78 
 
 
129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  63.78 
 
 
129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  63.78 
 
 
128 aa  180  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  61.72 
 
 
128 aa  179  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  64.89 
 
 
132 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  64.89 
 
 
132 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  66.93 
 
 
132 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  64.39 
 
 
132 aa  177  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  62.99 
 
 
129 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  64.06 
 
 
128 aa  176  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  58.59 
 
 
129 aa  176  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  61.24 
 
 
129 aa  176  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  65.35 
 
 
132 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  65.35 
 
 
132 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  64.57 
 
 
132 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  61.42 
 
 
129 aa  175  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  64.06 
 
 
128 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  61.72 
 
 
128 aa  174  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  60.47 
 
 
129 aa  173  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  60.63 
 
 
128 aa  172  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  63.28 
 
 
128 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  58.33 
 
 
132 aa  170  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  58.59 
 
 
128 aa  167  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  56.69 
 
 
128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  51.8 
 
 
149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1094  protein of unknown function DUF488  31.36 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0330  hypothetical protein  33.05 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2081  hypothetical protein  29.17 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  30.65 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  24.41 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4493  hypothetical protein  36.25 
 
 
140 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  29.17 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1901  hypothetical protein  28.33 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.45586  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1369  hypothetical protein  27.5 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.623897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2286  protein of unknown function DUF488  30.71 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1402  hypothetical protein  27.5 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.219828 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1385  hypothetical protein  27.5 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4425  hypothetical protein  27.52 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222644  normal  0.987297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3442  hypothetical protein  28.33 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3588  protein of unknown function DUF488  27.64 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1714  hypothetical protein  28.93 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.735817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2259  protein of unknown function DUF488  27.73 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0239  protein of unknown function DUF488  24.37 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0106  protein of unknown function DUF488  29.17 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1515  protein of unknown function DUF488  29.17 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.933464  normal  0.210794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  30.97 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1902  protein of unknown function DUF488  25.71 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.963702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3358  protein of unknown function DUF488  29.66 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  29.33 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4646  hypothetical protein  29.66 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3092  hypothetical protein  30.95 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0551  protein of unknown function DUF488  32.28 
 
 
126 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  30.84 
 
 
224 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22160  hypothetical protein  31.48 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2498  hypothetical protein  25.42 
 
 
125 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  30.43 
 
 
166 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3431  hypothetical protein  26.02 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00932776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1965  protein of unknown function DUF488  26.83 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  28.3 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2225  protein of unknown function DUF488  30.97 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2617  protein of unknown function DUF488  24.37 
 
 
115 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3631  hypothetical protein  29.2 
 
 
124 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50620  hypothetical protein  27.97 
 
 
157 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0346513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>