40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2981 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  273  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  70.45 
 
 
129 aa  196  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  67.94 
 
 
128 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  65.91 
 
 
128 aa  189  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  64.39 
 
 
128 aa  186  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  65.15 
 
 
128 aa  186  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  64.34 
 
 
129 aa  185  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  65.91 
 
 
128 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  63.64 
 
 
129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  62.88 
 
 
129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  59.86 
 
 
149 aa  177  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  62.6 
 
 
129 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  62.6 
 
 
129 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  62.6 
 
 
129 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  62.6 
 
 
129 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  62.6 
 
 
129 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  62.6 
 
 
129 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  63.36 
 
 
128 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  62.12 
 
 
132 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  60.31 
 
 
129 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  61.07 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  61.07 
 
 
128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  61.83 
 
 
132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  61.36 
 
 
128 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  61.07 
 
 
132 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  60.31 
 
 
132 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  57.25 
 
 
128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  57.58 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  57.58 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  59.54 
 
 
132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  59.54 
 
 
132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  59.54 
 
 
132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  56.06 
 
 
128 aa  157  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  58.33 
 
 
136 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2463  hypothetical protein  31.54 
 
 
169 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1714  hypothetical protein  32.56 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.735817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4493  hypothetical protein  28.8 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0228  hypothetical protein  26.98 
 
 
118 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0222  hypothetical protein  26.98 
 
 
118 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2555  hypothetical protein  37.23 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>