57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4234 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  99.24 
 
 		 132 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  89.39 
 
 		 132 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  87.02 
 
 		 132 aa  230  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  86.26 
 
 		 132 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  85.5 
 
 		 132 aa  220  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  85.5 
 
 		 132 aa  220  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  78.74 
 
 		 128 aa  215  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  80.31 
 
 		 129 aa  213  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  77.17 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  77.17 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  77.17 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  77.17 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  77.17 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  76.38 
 
 		 129 aa  204  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  75.59 
 
 		 128 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  71.65 
 
 		 128 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  67.72 
 
 		 129 aa  183  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  66.92 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  64.62 
 
 		 132 aa  175  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  64.62 
 
 		 132 aa  175  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  67.19 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  64.23 
 
 		 149 aa  174  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  66.14 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  66.14 
 
 		 129 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  64.06 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  66.14 
 
 		 128 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  65.35 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  60.31 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  58.91 
 
 		 129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  64.57 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  61.42 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  66.93 
 
 		 136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  58.59 
 
 		 128 aa  157  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0106  protein of unknown function DUF488  34.17 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  31.15 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2628  hypothetical protein  27.12 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3442  hypothetical protein  29.51 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2498  hypothetical protein  27.12 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0599  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000224589 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4793  protein of unknown function DUF488  32.05 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0905934 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1714  hypothetical protein  32.93 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.735817  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  26.36 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2225  protein of unknown function DUF488  32.08 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1901  hypothetical protein  29.03 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.45586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2081  hypothetical protein  29.03 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000626921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  29.37 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  31.53 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3631  hypothetical protein  30.58 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0778  protein of unknown function DUF488  30 
 
 		 124 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000129789  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1898  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.715816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  31.01 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2463  hypothetical protein  30.16 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0330  hypothetical protein  31.4 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1965  protein of unknown function DUF488  27.87 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2259  protein of unknown function DUF488  28.57 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22160  hypothetical protein  30.63 
 
 		 126 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>