41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3342 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  84.38 
 
 		 128 aa  229  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  74.8 
 
 		 132 aa  200  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  74.02 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  74.02 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  74.02 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  74.02 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  74.02 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  73.23 
 
 		 129 aa  196  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  73.23 
 
 		 132 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  70.99 
 
 		 132 aa  196  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  72.44 
 
 		 129 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  68.7 
 
 		 132 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  68.7 
 
 		 132 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  70.31 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  72.44 
 
 		 132 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  68.12 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  71.65 
 
 		 132 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  65.91 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  67.97 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  70.87 
 
 		 132 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  70.87 
 
 		 132 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  70.87 
 
 		 132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  66.41 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  66.41 
 
 		 129 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  65.62 
 
 		 128 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  64.84 
 
 		 128 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  64.06 
 
 		 128 aa  176  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  64.57 
 
 		 128 aa  174  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  64.06 
 
 		 128 aa  174  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  61.6 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  61.42 
 
 		 128 aa  170  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  61.42 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  61.72 
 
 		 136 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  30.51 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  26.36 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  29.51 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2286  protein of unknown function DUF488  30.95 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2463  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3631  hypothetical protein  29.27 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1094  protein of unknown function DUF488  23.73 
 
 		 113 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>