61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2717 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  269  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  97.67 
 
 
129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  69.29 
 
 
128 aa  191  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  70.31 
 
 
128 aa  190  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  69.53 
 
 
128 aa  188  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  66.67 
 
 
129 aa  187  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  69.53 
 
 
128 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  68.5 
 
 
128 aa  186  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  67.19 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  63.64 
 
 
132 aa  181  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  66.41 
 
 
128 aa  180  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  64.57 
 
 
129 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  64.57 
 
 
129 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  64.57 
 
 
129 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  64.57 
 
 
129 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  64.57 
 
 
129 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  64.57 
 
 
129 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  64.57 
 
 
129 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  64.06 
 
 
128 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  66.14 
 
 
132 aa  173  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  66.14 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  58.99 
 
 
149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  61.72 
 
 
129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  62.5 
 
 
128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  64.57 
 
 
132 aa  170  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  63.36 
 
 
132 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  63.36 
 
 
132 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  63.78 
 
 
132 aa  168  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  64.12 
 
 
132 aa  168  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  61.24 
 
 
136 aa  163  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  63.78 
 
 
132 aa  159  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  63.78 
 
 
132 aa  159  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  62.2 
 
 
132 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  53.6 
 
 
128 aa  147  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3653  protein of unknown function DUF488  29.46 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000515304  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0599  hypothetical protein  31.97 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000224589 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4793  protein of unknown function DUF488  25.41 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0905934 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3358  protein of unknown function DUF488  29.91 
 
 
123 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1211  hypothetical protein  30.25 
 
 
120 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0289  hypothetical protein  26.61 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0136906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4425  hypothetical protein  27.83 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222644  normal  0.987297 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2081  hypothetical protein  28.69 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  33.33 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  28.32 
 
 
171 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1898  hypothetical protein  25 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.715816  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1714  hypothetical protein  26.23 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.735817  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  26.89 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3588  protein of unknown function DUF488  31.31 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2617  protein of unknown function DUF488  26.26 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1902  protein of unknown function DUF488  27.1 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.963702  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3373  hypothetical protein  26.83 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1901  hypothetical protein  27.87 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.45586  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1369  hypothetical protein  27.87 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.623897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1402  hypothetical protein  27.87 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.219828 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1385  hypothetical protein  27.87 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  31.67 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0106  protein of unknown function DUF488  30.89 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1662  hypothetical protein  32.1 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3442  hypothetical protein  25 
 
 
114 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0334  hypothetical protein  29.49 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0507685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  30.28 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>