45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5399 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  78.74 
 
 
132 aa  216  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  78.74 
 
 
132 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  77.17 
 
 
129 aa  213  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  75.59 
 
 
129 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  75.59 
 
 
129 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  75.59 
 
 
129 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  75.59 
 
 
129 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  75.59 
 
 
129 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  76.38 
 
 
132 aa  209  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  74.8 
 
 
129 aa  208  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  74.8 
 
 
132 aa  206  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  73.23 
 
 
132 aa  196  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  73.23 
 
 
132 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  73.23 
 
 
132 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  70.31 
 
 
128 aa  192  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  67.18 
 
 
132 aa  187  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  67.97 
 
 
128 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  64.89 
 
 
132 aa  181  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  64.89 
 
 
132 aa  181  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  60.16 
 
 
129 aa  172  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  62.5 
 
 
129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  61.36 
 
 
132 aa  170  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  63.78 
 
 
128 aa  169  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  61.72 
 
 
129 aa  168  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  58.7 
 
 
149 aa  167  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  63.28 
 
 
128 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  56.25 
 
 
129 aa  165  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  62.5 
 
 
128 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  61.72 
 
 
128 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  58.59 
 
 
128 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  56.69 
 
 
128 aa  159  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  58.27 
 
 
128 aa  159  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  61.72 
 
 
136 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0106  protein of unknown function DUF488  30.83 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  27.97 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1898  hypothetical protein  26.19 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.715816  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  25.6 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3442  hypothetical protein  23.97 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0778  protein of unknown function DUF488  33.33 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000129789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2259  protein of unknown function DUF488  25.21 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2225  protein of unknown function DUF488  29.03 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1965  protein of unknown function DUF488  25.81 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2628  hypothetical protein  24.58 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3358  protein of unknown function DUF488  27.97 
 
 
123 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>